南京城作为明朝故都，其城防体系极为完备，光是城墙就分为四重，分为外城、内城、皇城和宫城，皇城如今变成了满城，宫城则成为满洲八旗贵胄的专享之地。而城门亦不在少数，其中承担主要防御任务的外郭有城门十八，内城十三，堪称这个时代最为顶级的巨城之一。
要攻打这么一个巨城，并不容易，仅仅围城，便需要海量兵马。
在领兵到达南京城外后，楚国公、明军兵马大都督孙稷侠即分派兵马，进逼外城各大城门。他以左军李昭部两万余人，负责江东门，大、小驯象三门攻略；以浙军杜怀仁部两万人，负责姚坊、仙鹤、麒麟三门攻略；以闽军郑成功部，负责观音、佛宁、上元三门攻略，并以威孚水师封锁长江、隔绝内外，同时威逼定淮、仪凤两门。
孙稷侠则亲督中军四万人，主攻大、小安德门，凤台门，夹岗门，至此，明军对南京完成合围之势。
除此之外，明军还将东面的上方、高桥、沧波三门，留出来作为清军的生门，以合“围三阙一”之道。
合围之后，孙稷侠即令辅兵营、随征民夫，伐木掘石，打造攻城器械，经过三日战前准备，明军终于“磨刀霍霍向猪羊”。
隆武元年十二月初一清晨，凤台门外，军旗漫卷、霜寒鼓重。
顶盔掼甲、身披厚重披风的孙稷侠，在赵清淮、关星河、张煌言、张若淳等一众文武大将簇拥下，扶剑立于高台之上。
目光所及之处，是杀气腾腾的四万明军主力；而在他看不见的地方，还有整整七万大军正在整装待命，蓄势待发。
此时，孙稷侠的意志，即代表了十一万明军将士的意志，也决定了数十万将士、上百万生灵的死生存亡，这是一种非常奇妙的感觉，一种让他能贯彻天地的力量感。
没有什么豪言壮志，也没有激怀壮烈，孙稷侠仅是一声“攻”字，便有鼓声擂动，号旗挥舞，快马四出。
随后，十一万大军向南京外城发起了全面攻击，一时间，整个南京城都被响彻天地的喊杀声所包围。
所有的运筹帷幄、阴谋诡计在这一刻都不再重要，惟有刀枪方可见真章！
此次围攻南京，孙稷侠采取了军师张煌言的策略，集中了神鸦军全军大小火炮八十余门，猛烈轰击凤台门，并将自己的大纛旗立于此处主攻明军的后方，意为凤台门为明军主攻之方向。
“轰轰轰”
随着号旗挥舞，明军炮阵中响起震天动地的炮击声，八十余门红衣大炮、佛朗机炮昂首向天，炮口喷出炽热的火焰，沉重的实心炮弹呼啸着划破晨雾，如流星般砸向南京城墙。轰鸣声中，砖石飞溅，浓烟滚滚，城墙的雉堞被轰得支离破碎，不断有清兵或被气浪掀下城墙，或被铁弹当场砸成肉酱。
炮击整整持续了半个多小时，直到炮膛发热，方才停休。
此时，攻防双方都清楚，更加惨烈的战斗即将到来。
自古以来，攻城战都是残酷而血腥的，但也正因如此，“先登”之功，才能位列四大军功之首，才能被楚国公以“封侯进爵”重赏！
主攻凤台门的明军主将乃是赣北总兵赵信，他率部自投效孙家军以来，所立皆为微末尺寸之功。赵信每每思及，总觉愧对老督师黄道周的厚望。
但这次，他总算有了一次表现的机会，而且是在主帅面前表现的机会，这让他心中热血澎湃。
待硝烟稍散，身负三层重甲的赵信，拔出佩剑，高声喝道：“弟兄们，建功立业，就在此时！”
霎时间，早已完成作战准备的七千赣军将士们，如同打了鸡血一般，在各级将校的带领下，向凤台门发起了热血冲锋，攻城锤、楼车等大型攻城器械在赣军将士们的推动下，缓缓向城门逼近。与此同时，云梯兵们扛着长梯，呐喊着冲向城墙冲去。
身后的明军箭阵亦随队推进，待至射程时，遂将一轮轮箭雨抛射出去，遮天蔽日的箭雨朝着城头倾泻而下。清军纷纷躲进掩体，然而仍有不少人被利箭射中，城墙上哀嚎声不断。
而一直在密切关注明军攻势的李成栋，眼见反击时刻到来，遂下令炮击。
清军在南京城头装备的火炮数量并不少，先前只是碍于明军距离较远，李成栋才没有下令开炮，现在眼见敌军已进射程，再不客气，亦以火炮击之。
登时，随着城头二十多门红衣大炮的开火，城外推进的赣军将士随即死伤数十人，此时冲城的赣军将士们心里都清楚，退后比前进更危险，况且军法无情，他们除了咬紧牙关向前冲，别无他法！
只要冲到城下，大炮就再也轰不到他们了！
但是大炮轰不到了，却还有更加惨烈的杀器在等着他们！
李成栋眼见明军将士悍不畏死，攻势更猛，于是又令手下亲兵组成督战队，手持鬼头大刀，将那些躲在城垛后面的清兵们纷纷逼出，以阻击明军推进。
城墙上的清军在鬼头大刀的威逼下，只好冒着箭雨反击。有操起弓箭射箭者，有以火铳鸟枪射击者，还有搬起事先准备好的滚木礌石，朝着城下的明军狠狠砸去的；
密集的箭矢、铳子如飞蝗般射向城下，明军的盾牌手们结成盾阵，尽力抵挡着箭矢，但仍有不少人被射中要害，倒在血泊之中。沸油、金汁顺着云梯倾泻而下，许多明军士兵被烫得惨叫连连，从半空中坠落。
明军士兵们踩着同伴的尸体，冒着枪林弹雨，前赴后继地冲向城墙，刀光剑影闪烁，鲜血四处飞溅，双方士兵不断有人坠下城墙，摔得血肉模糊。
战斗从清晨一直持续到黄昏，凤台门下尸横遍野，血流成河，甚至于让许多将士连平稳站立于此都十分艰难。明军虽然攻势凶猛，数次攻上城头，但清军依托坚固的城墙拼死抵抗，使得每一寸城墙的争夺都异常艰难，数波先登明军最终都因后续援军断绝，而尽数战死于城头。
一将功成万骨枯！