第一章：夏夜异兆昭和三十三年的夏天，格外闷热。东京市内的空气仿佛都被烤得扭曲起来，蝉鸣声在燥热的空气中愈发刺耳。街道上行人寥寥，大家都躲在家中，享受着为数不多的清凉。少年凉太在家中待得烦闷，趁着夜色，偷偷溜出了家门。他沿着小巷前行，月光洒在地上，拉出他长长的影子。突然，一阵沙沙声打破了夜的寂静，像是有人拖着沉重的脚步在地面上缓缓前行。凉太心中一惊，停下了脚步，紧张地四处张望。月光下，一道黑影从墙角缓缓掠过。凉太定睛一看，竟是一只狰狞的骨爪，正紧紧地抓着一个褪色的灯笼。那灯笼在夜风中摇曳不定，发出微弱的光，映照着骨爪的主人——一个面容扭曲的妖怪。凉太吓得差点叫出声来，他赶紧捂住嘴巴，转身拼命往家跑。与此同时，开旧书店的中年男人中禅寺秋彦正在店里整理书籍。突然，店门被猛地推开，一个穿着警察制服的男人冲了进来。他就是刑警木场修太郎，此时他满脸焦急，额头上满是汗珠。“京极堂，银座那边连续三天出现了‘灯笼怪谈’，目击者都描述看到了提着灯笼的鬼影，而且还有个孩子失踪了！”木场修太郎喘着粗气说道。京极堂放下手中的书，皱了皱眉头，沉思片刻后说道：“这恐怕不是普通的案件，你先回去，我随后就到。”木场修太郎离开后，京极堂关上店门，带上自己的工具，前往银座。到达现场后，他在废墟间仔细搜寻着。突然，他发现了一些微弱的妖气残留。顺着妖气的方向，他在一处阴暗的角落找到了半截燃烧过的符纸。他轻轻拾起符纸，仔细观察上面的纹路和材质，心中隐隐有了些许推测。第二章：百鬼契约驱魔师濑川凛子接到消息后，也赶到了银座。她精通古籍，对各种妖魔鬼怪的知识了如指掌。在仔细研究了案发现场的一些线索后，她查出《宇治拾遗物语》中记载的“百鬼契”可能会引发百鬼夜行的异象。“百鬼契是一种古老的契约，一旦与妖怪签订，就会引发一系列诡异的事件，其中最可怕的就是百鬼夜行。如果不及时阻止，后果不堪设想。”濑川凛子忧心忡忡地说道。就在这时，一个神秘的中国商人周启明现身了。他带着一幅鸟山石燕的《百鬼夜行绘卷》真迹，找到京极堂和濑川凛子。“这幅绘卷是解开百鬼夜行之谜的关键。我听说你们在调查此事，所以特来相助。”周启明说道。京极堂和濑川凛子对视一眼，心中充满了疑惑。他们仔细检查了绘卷，发现绘卷夹层藏着一张用人皮绘制的契约。契约上的字迹模糊不清，但隐隐散发着一股邪恶的气息。“这是当年某个阴阳师为了复活挚爱，以自身为祭品与妖怪签订的契约。如今，契约似乎被某种力量触动，百鬼夜行即将重现。”濑川凛子分析道。第三章：鬼王觉醒失踪儿童的尸体在荒川被发现，这一消息让整个东京陷入了恐慌。尸体的胸口浮现出天狗纹，这让京极堂等人意识到，妖怪领袖“大天狗”可能已经苏醒。“大天狗是日本传说中的强大妖怪，它若真的苏醒，东京必将陷入一场灾难。”京极堂说道。濑川凛子决定前往神社遗址进行调查。在那里，她遭遇了河童群的攻击。河童们身形矮小，却力大无穷，它们挥舞着手中的武器，向濑川凛子发起了猛烈的攻击。经过一番激烈的搏斗，濑川凛子终于击退了河童群。在战斗结束后，她发现地底埋着刻有“百鬼夜行”字样的青铜镜。青铜镜表面布满了灰尘，但依然散发着神秘的光芒。与此同时，周启明的仓库突发火灾。京极堂和木场修太郎赶到现场时，火焰已经吞噬了整个仓库。在灰烬中，他们找到了一块烧焦的轮入道车轮残骸。车轮上镶嵌着写满亡者姓名的木牌，每一个名字都仿佛带着无尽的怨念。第四章：阴阳逆转京都的阴阳寮传来密信，信中揭示了百鬼契约需集齐“三神器”才能解除。这三神器分别是八咫镜、草薙剑和八尺琼勾玉。目前，八咫镜在伊势神宫产生异动，似乎有一股神秘的力量在牵引着它。濑川凛子在浅草寺遭到了涂佛的袭击。涂佛身形巨大，面目狰狞，它张开双臂，向濑川凛子扑来。在危急时刻，濑川凛子拿出反柱木屑，撒向涂佛。反柱木屑散发着一股刺鼻的气味，涂佛接触到木屑后，身体开始变形，最终化作了灰烬。然而，就在众人以为危机暂时解除时，凉太在家中突然昏倒。他的背上浮现出青色的鬼手印，仿佛被妖怪缠身。京极堂诊断后称，凉太成为了“生灵容器”，体内寄宿着饿死鬼鼬五郎。第五章：百鬼横行时间到了农历七月十五，子时刚过，东京的街头突然出现了奇景。无数妖怪提着灯笼，组成了一列长长的队伍，如同庙会游行一般。骨女、垢尝、见越入道等妖怪纷纷现身，它们面目狰狞，眼神中透露出贪婪和凶狠。周启明在混乱中露出了额间的第三只眼，他操纵着凤凰火焚烧街道，试图掩盖自己的行踪。原来，他是平安时代阴阳师的后裔，妄图借助百鬼之力复活祖先。京极堂意识到，必须尽快阻止周启明的阴谋。他手持刀剑，与周启明展开了一场激烈的对决。两人在火光中你来我往，刀光剑影闪烁不停。与此同时，凉太体内的鼬五郎感受到了外界的战斗，它也爆发出了强大的力量。凉太挥舞着手中的匕首，冲向周启明。然而，周启明太过强大，凉太不慎被周启明贯穿了胸膛。就在凉太生命垂危之际，百鬼契约突然反噬，周启明被一股强大的力量吞噬。京极堂趁机施展法术，将妖怪们一一封印
但就在京极堂以为危机解除时，封印的妖怪们竟发出阵阵嘶吼，封印开始摇摇欲坠。原来，周启明虽死，可他之前的布局已让百鬼契约的力量过于强大，反噬只是暂时削弱了它。此时，伊势神宫的八咫镜光芒大盛，竟自行飞到了空中，似要与其他妖怪呼应。濑川凛子突然想到，三神器或许还能发挥作用。她与京极堂、木场修太郎迅速赶往伊势神宫，拿到八咫镜后，又快马加鞭去寻找草薙剑和八尺琼勾玉。而凉太在濒死之际，体内的鼬五郎竟与他达成了某种契约，鼬五郎借助凉太的身体，爆发出一股奇异的力量，帮助众人抵挡妖怪的攻击。众人一边抵挡妖怪，一边寻找三神器，一场关乎东京存亡的最终决战，即将到来……
他们打听到草薙剑在一位隐居的剑圣手中，八尺琼勾玉则在一座被妖怪守护的古墓里。众人兵分两路，京极堂和濑川凛子去寻草薙剑，木场修太郎带着凉太（鼬五郎附身）去取八尺琼勾玉。京极堂和濑川凛子见到剑圣后，诚恳说明来意，剑圣被他们拯救东京的决心打动，将草薙剑相赠。而木场修太郎这边，凉太体内的鼬五郎发挥出强大妖力，与守护古墓的妖怪展开殊死搏斗。在激烈战斗中，凉太逐渐掌握了与鼬五郎的力量融合，成功拿到八尺琼勾玉。三神器集齐，众人赶回东京。此时，百鬼的力量愈发强大，封印摇摇欲坠。京极堂、濑川凛子、木场修太郎和凉太站在一起，借助三神器的力量，施展出强大法术，与百鬼展开最终对决。光芒闪过，百鬼被成功封印，东京恢复了往日的平静。