医史法庭的时空回廊突然剧烈震颤，十二座审判席的青铜巨柱渗出暗紫色液体，将整个法庭染成诡异的色调。AI法官的数据流扭曲成螺旋状，发出刺耳的警报：“检测到历史线异常波动，华佗、李时珍等医疗先哲的意识印记正在消失！”林婉的智能手环投影出破碎的时间线，无数历史片段如雪花般纷飞。
“是黑袍科学家！他在篡改医疗史的关键节点！”秦逸展开太初医典，泛黄的书页却呈现出空白状态——医典中记载的历史正在被熵能侵蚀。银发老者的战甲闪烁着应急红光：“必须立即启动‘溯流计划’，但穿越历史会引发蝴蝶效应，风险极大！”
当归舰启动针灸跃迁，却在穿越时空隧道时遭遇强烈阻力。舱室内，林婉的纳米机器人突然反向攻击，它们的表面浮现出黑袍科学家的扭曲面容：“回去吧，愚蠢的医者。当神农尝百草失败，当麻沸散从未问世，现代医疗将成为无根之木！”秦逸甩出银针，布下“九宫护心阵”，金色真气与纳米机器人的黑色能量激烈碰撞。
他们的第一站是上古神农时代。原本青翠的百草谷弥漫着毒雾，神农氏倒在地上，脸色发黑。“有人提前在草药中下了致死之毒！”林婉检测到空气中的熵能残留，“如果神农就此陨落，人类将永远失去辨药的能力！”秦逸迅速取出太素金针，刺入神农的“人中”“内关”等穴位，同时将太初医典的净化之力注入其经脉。金色光芒驱散毒雾的瞬间，黑袍科学家的意识残片凝聚成实体，他挥动暗紫色触手，将所有草药化作吞噬生命的怪物。
“以五行相生之法破之！”秦逸调动体内真气，在虚空中画出“木生火”的符文。当归舰的藤蔓护盾化作火焰，将怪物焚烧殆尽。但当神农苏醒，时间线并未完全修复——黑袍科学家早已篡改了神农的记忆，让他对草药产生恐惧。
林婉发现时空裂缝中残留的能量波动，立即追踪至东汉末年。刑场之上，华佗的“麻沸散”配方正被狱卒投入火中，曹操的士兵举着屠刀逼近。“历史记载华佗因拒绝开颅被杀，但此刻的熵能指向另一个真相！”林婉将纳米机器人化作无形，潜入士兵的意识。震惊地发现，是黑袍科学家残片伪装成曹操谋士，蛊惑曹操认为华佗是“未来威胁”。
秦逸甩出银针，定住所有士兵的行动，林婉则趁机抢回配方。但当他们准备修正历史时，黑袍科学家的笑声再次响起：“你们以为改变过去就能胜利？看看你们身后！”时空突然扭曲，两人被传送到明朝李时珍撰写《本草纲目》的现场。原本堆满草药的案几空空如也，李时珍蜷缩在角落，口中喃喃自语：“药无用……医无用……”
“他的意识被熵能彻底污染了！”秦逸运转九阳正气诀，金色火焰焚烧着缠绕在李时珍身上的暗紫色锁链。林婉将《黄帝内经》的医道精要转化为意识波，注入李时珍的识海。当老人眼中重新亮起光芒，时空突然剧烈震荡，黑袍科学家的身影带着万千熵兽从裂缝中涌出：“够了！你们的挣扎，不过是加速历史的崩塌！”
危急时刻，秦逸突然发现太初医典的空白页开始浮现文字——那是上古医神留下的警示：“历史不可强改，需以因果为药引。”他与林婉对视一眼，同时将自身真气与太初医典融合，在虚空中绘制出巨大的“因果循环图”。金色光芒笼罩整个时空，黑袍科学家的攻击被反弹，他的残片发出不甘的嘶吼，消散在历史的长河中。
当当归舰回到现代，医史法庭的青铜巨柱恢复了光泽。但林婉检测到时空深处仍有微弱的熵能波动——黑袍科学家虽未改变历史，却在某些平行世界留下了篡改的种子。秦逸握紧太初医典，眼神坚定：“无论他躲在哪个时空，我们都会找到他。医道的传承，不容亵渎。”而在某个未知的时空角落，黑袍科学家的残片正注视着他们，嘴角勾起一抹阴冷的笑。