元门在中州经营千年，麾下共有七大附属宗门，分别是毒瘴门、血魂教、黑风寨、幽冥殿、骨魔门、噬魂谷、灭神宗。这些宗门各自盘踞一方，依靠元门的庇护，残害百姓，掠夺资源，早已引起中州修士的不满。
萧凡率领联盟军，兵分七路，向七大附属宗门发起进攻。东路军由萧凡亲自率领，进攻实力最强的灭神宗；西路军由冷秋颜率领，进攻毒瘴门；南路军由月离率领，进攻血魂教；北路军由王泽率领，进攻黑风寨；其余三路则由赵子龙、玄罗、许逸率领，分别进攻幽冥殿、骨魔门、噬魂谷。
灭神宗位于中州东部的灭神山，宗门内布满灭神符文，擅长神魂攻击。萧凡率领大军抵达山脚下时，灭神宗宗主灭无神早已率领弟子列阵以待。灭无神是轮回境圆满巅峰修为，手持灭神枪，周身萦绕着黑色的神魂之力，气势汹汹。
“萧凡，元门已灭，但我灭神宗可不是好惹的！” 灭无神怒吼着，灭神枪一挥，无数道黑色的神魂之刃向联盟军射去。
萧凡冷哼一声，大帝境圆满的威压弥漫开来，神魂之刃在威压下瞬间破碎。他手持天荒诛魔戟，纵身跃起，金色戟气劈向灭无神：“灭神宗残害修士，掠夺神魂，今日便让你宗彻底覆灭！”
灭无神脸色大变，灭神枪横挡，却被戟气震得连连后退，虎口崩裂。他不敢置信地看着萧凡：“大帝境圆满…… 你竟然突破到了大帝境圆满！”
“现在知道，太晚了！” 萧凡身影一闪，出现在灭无神身后，天荒诛魔戟刺穿了他的胸膛。灭无神发出一声惨叫，身体在金光中消融。失去宗主的灭神宗弟子瞬间陷入混乱，联盟军趁机发起进攻，短短半个时辰，灭神宗便被彻底肃清。
与此同时，西路军的冷秋颜也攻破了毒瘴门。毒瘴门擅长毒术，门内布满毒瘴，却被冷秋颜的星焰焚烧殆尽。毒瘴门门主毒千面是轮回境后期修为，与冷秋颜激战数十回合后，被星焰剑气斩杀，毒瘴门弟子纷纷投降。
南路军的月离则净化了血魂教。血魂教以吸食修士精血为生，门内储存着大量精血，月离的金色冰焰不仅净化了精血中的阴邪之力，还将血魂教的建筑焚烧殆尽，血魂教教主血无常被冰焰冻结，最终化为飞灰。
北路军的王泽攻破黑风寨时，黑风寨寨主黑风老妖正准备携宝逃窜，却被王泽的帅印砸中，当场陨落。幽冥殿、骨魔门、噬魂谷也在赵子龙、玄罗、许逸的进攻下，先后覆灭。
七大附属宗门的覆灭，彻底清除了元门在中州的残余势力。联盟军在肃清过程中，缴获了大量的资源：毒瘴门的解毒丹配方、血魂教的精血提纯术、黑风寨的矿产资源、幽冥殿的幽冥符文图谱、骨魔门的傀儡炼制术、噬魂谷的神魂修炼法、灭神宗的灭神枪，这些资源被萧凡统一收管，准备用于中州的重建和魔国的发展。
肃清行动结束后，萧凡率领联盟军返回幽冥城。消息传遍中州，所有势力都被萧凡的实力和决心震慑，再也无人敢与魔国和联盟作对。