横户镇宝可圆环大会的激情与荣誉逐渐被抛在身后，小玲和大王燕的出色表现无疑为团队注入了新的活力。然而，小星心中因那些觊觎奖励的混混而产生的警惕并未放松。他们的下一个目标是拥有飞行系道馆的茵郁市。为了应对道馆挑战，小星开始有意识地寻找能扩充队伍、应对飞行系宝可梦的伙伴。
旅途中，他们经过一片阳光充沛、生长着巨大芭蕉叶般树木的区域。一只体型庞大、颈部长着类似香蕉叶的黄色果实、性情温和的热带龙正在树荫下悠闲地吃着树叶。它那宽大的翅膀和草\/飞行属性，正是应对其他飞行系宝可梦的理想选择。
【宝可梦：热带龙】
【属性：草\/飞行】
【情绪状态：温和，悠闲，对陌生人不排斥】
“热带龙……很适合的道馆战备选。”小星评估着，“喷火龙，准备战斗！”他派出了自己最初、也是最强的伙伴，以示尊重，也为了确保收服过程高效且不给对方造成过多痛苦。
喷火龙的出现让热带龙警惕起来。战斗迅速展开。喷火龙凭借属性优势和丰富的战斗经验，以“喷射火焰”进行威慑和控制，避免近身战可能对热带龙造成的过大伤害。几个回合后，热带龙被一道精准控制的火焰逼入角落，气喘吁吁。小星看准时机，掷出精灵球，成功收服。
与此同时，在一条清澈的河流边休整时，小叶拿出了钓竿，尝试进行垂钓。她并非为了战斗，更多是出于协调训练家对各类宝可梦的好奇与欣赏。几次尝试后，鱼竿猛地一沉！她奋力拉起，钓上来的却是一只外表灰蓝、看起来有些呆滞甚至“丑陋”的宝可梦——丑丑鱼。
【宝可梦：丑丑鱼】
【属性：水】
【情绪状态：迟钝，对外界反应缓慢，似乎对自己的外貌毫无自觉】
“是丑丑鱼啊……”小玲眨了眨眼，语气有些微妙。
小叶却蹲下身，仔细打量着这只看似不起眼的宝可梦。她记得绫子小姐说过，真正的美丽在于内在与潜力。“可可多拉，稍微吓唬它一下，注意分寸。”她派出可可多拉，利用其沉重的脚步声和低吼让丑丑鱼受惊跳回水中，随后再次抛竿。当丑丑鱼再次被钓起时，小叶迅速而温柔地用精灵球碰了碰它，成功收服。她相信，每只宝可梦都有其独特的光芒，只是需要发现和雕琢。
继续前行，天气却开始变得诡异。原本晴朗的天空骤然阴沉，豆大的雨点毫无征兆地砸落，但仅仅几分钟后，雨幕中又夹杂起了细小的冰雹，气温忽高忽低，如同四季在短时间内疯狂交替。
“这天气太奇怪了！”小玲用手挡着冰雹，大声说道。
就在这时，他们注意到路边一只宝可梦正随着天气的变化而改变着形态——晴天时像一朵小云，雨天时像一滴雨滴，下冰雹时则像一颗小冰晶。正是能随天气变化形态的飘浮泡泡！它似乎也对这混乱的天气感到困惑和不安，在空中焦躁地飘浮着。
【宝可梦：飘浮泡泡】
【属性：一般】
【情绪状态：困惑，不安，被异常天气影响】
一位穿着研究员白袍、戴着眼镜的中年男性急匆匆地跑了过来，抱起了飘浮泡泡。“泡泡，你怎么跑出来了？哎呀，几位是路过的训练家吗？真是抱歉，这异常的天气是我们天气研究所的实验事故造成的。”他自我介绍是天气研究所的所长，“如果不介意，请来研究所避一避，顺便让我们表达一下歉意。”
对于这诡异的天气和专门研究天气的研究所，小星自然产生了兴趣。三人跟随所长来到了那座矗立在丘陵上、布满各种探测仪器的白色建筑——天气研究所。
研究所内，巨大的屏幕显示着丰缘地区各地的气象数据，其中一些区域闪烁着不正常的红光。所长一边带他们参观，一边解释道：“我们正在研究宝可梦招式与自然天气的关联，以及如何预测和应对极端天气。但最近设备似乎有些不稳定……”
在参观机械室，看着那些复杂的气象控制装置时，异变再次发生！刺耳的警报声骤然响起！研究所的主入口方向传来了混乱的打斗声和呵斥声！
“是海洋队！”一名研究员惊慌地跑进来报告，“他们突然袭击，抓住了外面的大部分研究员和几个鬼鬼祟祟在附近张望的陌生人！”
小星眼神一凛，果然又遇上了他们！
“他们往主机房去了！目标是储存着超古代宝可梦气象分析资料的主机！”所长焦急万分。
一名叫做咪莉的年轻女研究员侥幸躲过了第一波抓捕，与小星一行人汇合。“我知道一条备用通道可以去主机房！跟我来！”
情况危急，小星三人毫不犹豫地跟上咪莉，沿着狭窄的维修通道快速前行。通道外，能听到海洋队成员嚣张的叫嚷和宝可梦对战的爆炸声。
他们成功绕到了主机房的后方观察窗。透过窗户，可以看到几名海洋队成员正在试图破解主机密码，而他们的头目，一个身材高瘦、眼神阴鸷的男人，正指挥着：“动作快！一定要拿到盖欧卡的原始数据！有了它，我们就能真正掌控海洋，唤醒并控制那位大人！”
盖欧卡！又是超古代宝可梦！海洋队的目标果然是它！
“必须阻止他们！”小星低声道。
“可是他们人很多，还有宝可梦守卫……”咪莉担忧地说。
就在这时，小玲怀中的飘浮泡泡似乎感受到了紧张的气氛和空气中紊乱的能量，它挣脱小玲的怀抱，飘到一台尚在运行的、小型的天气模拟装置旁，身体接触了上去。它那随着心情和天气变化的能力，似乎与这台装置产生了某种共鸣！
飘浮泡泡周身开始发光，它凭借自身奇特的能力，短暂地影响了局部区域的能量场！主机房内，灯光突然疯狂闪烁，几个显示屏瞬间黑屏，海洋队正在操作的终端也发出了错误的蜂鸣！
“怎么回事？！”海洋队头目惊怒道。
这短暂的混乱创造了机会！
“就是现在！”小星率先冲了进去，“沙基拉斯，恶之波动！”
“快龙，龙息！”
“大王燕，电光一闪干扰！”
“森林蜥蜴，种子机关枪！”
三人全力出手，攻其不备！沙基拉斯的恶之波动打乱了海洋队的阵型，快龙的龙息逼退了试图反抗的成员，大王燕和森林蜥蜴则迅速破坏了几个关键的数据连接线！
“又是你们这些碍事的小鬼！”海洋队头目认出了小星，咬牙切齿，“大狼犬，铁螯龙虾，拦住他们！”
激烈的战斗在主机房内爆发！小星的沙基拉斯和斗笠菇顶在前面，小叶的快龙和狩猎凤蝶提供强大火力支援，小玲的大王燕和森林蜥蜴则凭借速度进行骚扰和破坏。咪莉也鼓起勇气，指挥着研究所用于防卫的几只朝北鼻进行辅助。
海洋队虽然人数占优，但在狭窄空间内难以展开，加上小星三人配合默契，宝可梦实力强劲，渐渐落入下风。那只飘浮泡泡更是不断制造着小范围的天气扰动，时而让地面结霜减缓敌人速度，时而制造小片雨云干扰视线，起到了奇兵的作用。
眼看数据无法顺利盗取，手下也被压制，海洋队头目不甘地嘶吼：“撤退！暂时撤退！但这笔账我们记下了！”他们利用烟雾弹和宝可梦的掩护，仓惶地从原路逃离，连那些被抓的研究员和混混都顾不上了。
危机解除，研究所的异常天气也渐渐平息。所长和获救的研究员们对小星一行人感激不尽。
“多亏了你们，还有飘浮泡泡！”所长抱起飘浮泡泡，感慨道，“它似乎和你们很有缘，而且在关键时刻帮了大忙。”他看向小玲，“小玲姑娘，你愿意收下飘浮泡泡吗？它应该能成为你可靠的伙伴。”
小玲惊喜地看着那只依偎在所长怀里、此刻已恢复成小云朵形态、好奇望着她的飘浮泡泡，用力点头：“我愿意！谢谢您，所长！”
就这样，小玲的队伍里增添了一位能够呼应天气、能力特殊的伙伴——飘浮泡泡。
离开天气研究所时，小星的心情更加沉重。海洋队的目标明确，行动愈发猖獗，甚至连天气数据都成了他们企图掌控超古代宝可梦的工具。丰缘地区的局势，正在以惊人的速度滑向不可预测的深渊。而他们手中的力量，虽然不断增强，但面对这席卷而来的巨大浪潮，究竟能起到多大的作用？茵郁市的道馆挑战在即，但小星知道，真正的风暴，或许早已在他们身边酝酿。