有了大理寺的协同办案，案件的调查进度快了许多。按照制度，所有死刑案犯的卷宗，除刑部存档外，大理寺亦有一套备份以备复核。林文轩在大理寺的档案库中，果然查到了何三的完整记录，其上记载的面部特征、身形体态，均与死士“赵大勇”吻合。
至此，林文轩心中已有了清晰的推断：恐怕不止何三一人，其余几名死士，多半也是通过类似手法“死而复生”的。他立刻调动刑部所有可用人手，连夜排查近十年的死囚档案。结果令人心惊，在五至十年前期间，多个地方上报的死刑犯档案中，都出现了不同程度的缺失或被巧妙销毁的痕迹，手法如出一辙。
然而，陛下给出的五日之限已迫在眉睫，仅剩最后两天。想要在如此短的时间内，将这些死士的真实身份全部核实清楚已无可能。但现有的线索，已足够将矛头直指朝廷中枢——至少，户部与刑部内部，必有身居要职之人参与其中，方能完成如此大规模的偷梁换柱。
另一边，户部尚书陈之遴自御书房出来后，亦是心惊胆战，立刻回衙彻查“赵大勇”的户籍来源。很快便查明，此人的户籍信息确系后期补录，而经手办理此事的是户部一名不起眼的书吏，名为马士英。陈之遴立刻下令传唤马士英，下属却回报，马士英在两日前便已告假。心知不妙的陈之遴派人按其登记住址寻找，结果发现马士英已在其京中暂住的房屋内“自缢身亡”，现场留下一封“遗书”，信中自称是贪图钱财，受人指使篡改户籍，如今悔恨交加，唯有以死谢罪。
户部这条至关重要的线索，就此被人干净利落地斩断。
刑部这边，所有被篡改档案的时间点，都指向了前任刑部尚书卢奇然在任期间。卢奇然于四年前以年高体衰为由致仕，陛下念其多年勤勉，准其荣归故里。此人已在两年前病故，当时朝廷还曾发文哀悼，似乎一切早已尘埃落定。但朝野皆知，卢奇然有一女，嫁给了当今兵部尚书刘魏的嫡子刘权，两家乃是姻亲。这条线索指向了刘家，但卢奇然已死，线索到了这里，似乎也走进了死胡同。
案件再次陷入僵局。林文轩凝神细思，将之前前来认领“丈夫”的那几名妇人重新提出，分开进行严厉审讯。他敏锐地指出，她们虽自称来自京郊各县，但告示贴出后一两天内便能齐聚京城刑部衙门，背后定然有人组织。果然，一番审讯之下，有人熬不住，供出是刑部一名张姓主事提前通知她们前来，并许以重金。林文轩立即派人去拿这张主事，却得知此人早已不知所踪，家中亦是人去楼空。
林文轩又请来高强，仔细询问他看到告示的经过。高强坦言，自己如今在一大户人家做采购仆役，前日外出时听闻街坊议论官府贴出重金寻人的告示，出于好奇前去观看，才意外发现了仇人何三的画像，于是立刻撕下告示，连夜赶赴京城。其言谈举止，情真意切，并无破绽。
林文轩一边命书记官详细记录，一边对高强温言道：“何三罪大恶极，已然伏诛，陛下对此案极为重视。朝廷念你蒙受冤屈，特有一份补偿，连同此次提供线索的赏金，两日后便可下发，届时你再来衙门领取便是。”高强听闻大仇得报，感激涕零，叩首不止。
次日，前往涪城核查的差役回报，高强所言经历基本属实。虽然林文轩直觉中仍有一丝难以捕捉的疑虑，但在有限的时限内，确实已找不到新的突破口。
第五日一早，林文轩将数日来的调查结果整理成卷，呈递御前。他在奏报中明确，虽未查出直接指挥刺杀的幕后元凶，但案件脉络已基本清晰：户部书吏马士英伪造户籍，前任刑部尚书卢奇然任内档案被大规模篡改，死囚被替换培养成死士。同时他也暗示，若继续深挖，牵扯的各级官员必不在少数，而能让卢奇然如此行事，其背后之人地位定然极高，或关系特殊。
皇帝萧彻看完卷宗，沉默良久，方才开口：“林爱卿，你如何看待此事？”
林文轩躬身回答：“陛下，此案根基已明。若继续彻查，地方、朝堂涉及之官员，恐如蔓连枝，为数众多。目前看来，仅死囚来源便涉及五个州县，牵连甚广。”
这正是萧彻最担忧之处。他没想到一桩刺杀案，竟会牵扯出如此盘根错节的利益关联，甚至隐隐指向了手握兵权的刘魏。眼下，他还需要刘魏稳定军方，不愿与之彻底撕破脸。另外目前皇子之间的关系也不愿意打破平衡。
“那么，对于这些死士刺杀北定县主一事，爱卿又如何看？” 萧彻换了一个角度问道。
林文轩沉吟道：“以臣愚见，刺客目标表面是北定县主，实则是想通过破坏县主安危，进而打击景王殿下，阻挠和谈大局。若县主当真遇害，北狄方面或许会质疑我大晟保护使节、维护和谈环境的能力与诚意，和谈势必受阻。”
皇帝萧彻心中已然明了。这分明是刘家为了打击萧景玄，不惜铤而走险，手段狠辣且不顾大局。若不加以惩戒，日后难免变本加厉。他心中已有决断，对林文轩道：“此案，接着查。将下面那些胆大包天、参与此事的州县官员，给朕一个一个，都揪出来！严惩不贷！”
林文轩立刻明白了皇帝的意思——上面的线，暂时到此为止，不再深究；但下面的爪牙，必须彻底清理，以儆效尤。
“那这刺杀一事，对外该如何定论？” 林文轩请示道。
皇帝萧彻眼中闪过一丝冷光，给出了最终的定性：“刺杀一事，便对外宣称，是西夜国为破坏我大晟与北狄和谈，提前安插探子，收买亡命之徒所为。此案，就此结案。”
“臣，领旨。” 林文轩深深一揖。心中已然清楚，这朝堂之上的风云，远比刑案卷宗所记录的，更加波谲云诡。陛下此举，既是断尾求生，也是敲山震虎。