探索队返回灵音起源谷三个月后，沙沫随身携带的共生本源印记突然发出强烈的灰白光芒，印记表面浮现出紊乱的能量纹路。沙沫立即将情况上报给万界共生管理委员会，灵淼召集众人对印记进行检测，发现印记的能量波动与混沌界深处残存的“混沌余烬能量”高度契合。“难道混沌界还有未被彻底转化的能量源在躁动？”雷迅皱眉推测。光辰调取暗影洞察监测网的数据，发现在混沌界原核心区域的边缘，出现了一片“能量异常区”，区域内的混沌余烬能量正在快速聚集，形成新的能量漩涡。
为了查明异常原因，沙沫、雷迅带领一支由各族守护者组成的“危机应对队”前往探查。当队伍抵达能量异常区时，眼前的景象让众人警惕——原本已转化为共生雾霭的区域，竟有部分重新被黑色的混沌余烬能量覆盖，地面上的共生植物开始枯萎，一些低阶共生生物因能量侵蚀陷入狂暴状态。雷迅启动共生自适应战甲的探测模式，发现能量漩涡的中心，是一块未被完全转化的“混沌本源残片”，正是它在不断吸收周边的共生能量，转化为混沌余烬能量。
“必须尽快摧毁这块残片，否则它会污染更大范围的共生区域！”沙沫下令道。守护者们立即展开攻击，但混沌本源残片释放出的能量屏障异常坚固，传统的灵音攻击难以突破。就在此时，沙沫手中的共生本源印记再次发光，一道灰白能量光束从印记中射出，击中能量屏障后，屏障竟出现了裂痕。“印记能克制混沌余烬能量！”沙沫惊喜地喊道，她将印记的能量引导至自身的沙雷光合一本源灵音核心，释放出“沙韵共生破障波”，冲击波撞上屏障，裂痕瞬间扩大。
雷迅抓住机会，凝聚雷韵共生能，形成“雷炎共生破击炮”，对准裂痕发射。破击炮穿透屏障，击中混沌本源残片，残片剧烈震动，释放出更强烈的混沌余烬能量冲击波。危机应对队中的一名跨族混血少年——沙音族与光灵音族的后代沙耀，突然被冲击波击中，身体周围爆发出金白交织的光芒。当光芒散去，沙耀的双手竟能同时操控沙音能量与光灵音能量，两种能量在他手中融合成“沙光共生流”，这种能量流不仅能抵御混沌余烬能量，还能净化被侵蚀的共生植物。
沙耀的觉醒让众人看到了新的希望。危机应对队中其他跨族生灵也尝试将自身的两种灵音能量融合，在共生本源印记的引导下，多名跨族生灵成功觉醒“共生融合能”：风灵音与水灵音的混血少女风汐，觉醒出“风水共生旋”，能形成蕴含净化之力的能量漩涡；金灵音与木灵音的混血少年金柯，觉醒出“金木共生藤”，藤蔓兼具金属的坚硬与植物的韧性，可束缚狂暴生物并净化其体内的混沌余烬能量。
在觉醒者的协助下，危机应对队的战斗力大幅提升。沙沫与雷迅操控超级装置远程输送共生能量，为觉醒者提供支援；沙耀的沙光共生流负责破除残片的能量防御，风汐的风水共生旋净化周边的混沌余烬能量，金柯的金木共生藤束缚住因能量躁动而出现的混沌残兽。经过五个时辰的奋战，雷迅凝聚全队的共生融合能，发出“万界共生破邪炮”，彻底击碎了混沌本源残片。随着残片破碎，异常区的混沌余烬能量逐渐消散，枯萎的共生植物重新焕发生机，狂暴的共生生物也恢复了平静。
危机解除后，沙沫与雷迅将跨族生灵觉醒共生融合能的情况上报给万界共生管理委员会。灵淼意识到，这是共生时代赋予万界生灵的新力量，她决定成立“共生融合能学院”，专门培养觉醒共生融合能的跨族生灵，让他们成为守护万界共生秩序的重要力量。学院选址在共生过渡区的共生灵音森林旁，由沙耀、风汐、金柯等首批觉醒者担任导师，传授共生融合能的操控技巧。
共生融合能学院开学当天，沙沫在开学典礼上说道：“混沌与本源的融合，不仅改变了我们的世界，也改变了我们自身。共生融合能不是特权，而是责任，它让我们有能力守护这份来之不易的和平与共生。”雷迅补充道：“每一种新力量的诞生，都伴随着新的使命，希望你们能以共生为念，用这份力量创造更美好的万界。”台下的学员们齐声回应，声音中充满了坚定与希望。
夜晚，沙沫四人再次来到本源灵音坛前，共生本源印记与本源灵音火种的共鸣更加柔和。灵音故事树的树语中新增了共生融合能觉醒的篇章，时光友谊花的花瓣上浮现出危机应对队奋战与学院开学的场景。灵音世界的冒险与传承，在共生力量的不断进化中，开启了更加波澜壮阔的新篇章，而守护这份共生的信念，也深深烙印在每一位生灵的心中。